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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 70 | 125 | 36 | 17 | 17 | 102 | 73 | 29 |
| 2 | 仙台 | 75 | 123 | 35 | 18 | 22 | 107 | 81 | 26 |
| 3 | 鳥栖 | 74 | 122 | 36 | 14 | 24 | 98 | 86 | 12 |
| 4 | 東京V | 70 | 121 | 35 | 16 | 19 | 124 | 95 | 29 |
| 5 | 湘南 | 75 | 103 | 30 | 13 | 32 | 107 | 108 | -1 |
| 6 | 山形 | 74 | 90 | 23 | 21 | 30 | 82 | 87 | -5 |
| 7 | C大阪 | 53 | 89 | 27 | 8 | 18 | 78 | 60 | 18 |
| 8 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 9 | 愛媛 | 75 | 82 | 22 | 16 | 37 | 76 | 101 | -25 |
| 10 | 福岡 | 52 | 80 | 24 | 8 | 20 | 83 | 65 | 18 |
| 11 | 群馬 | 75 | 68 | 12 | 32 | 31 | 67 | 110 | -43 |
| 12 | 横浜F | 28 | 55 | 15 | 10 | 3 | 44 | 27 | 17 |
| 13 | 水戸 | 75 | 54 | 13 | 15 | 47 | 61 | 116 | -55 |
| 14 | 徳島 | 76 | 52 | 10 | 22 | 44 | 57 | 122 | -65 |
| 15 | 神戸 | 22 | 42 | 12 | 6 | 4 | 37 | 25 | 12 |
| 16 | 柏 | 22 | 36 | 11 | 3 | 8 | 41 | 34 | 7 |
| 17 | 広島 | 4 | 10 | 3 | 1 | 0 | 9 | 2 | 7 |
| 18 | 岐阜 | 5 | 7 | 2 | 1 | 2 | 8 | 7 | 1 |
| 19 | 甲府 | 5 | 4 | 0 | 4 | 1 | 3 | 4 | -1 |
| 20 | 熊本 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 4 | 6 | -2 |
