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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 63 | 117 | 34 | 15 | 14 | 93 | 61 | 32 |
| 2 | 仙台 | 66 | 112 | 32 | 16 | 18 | 97 | 72 | 25 |
| 3 | 東京V | 62 | 111 | 32 | 15 | 15 | 113 | 81 | 32 |
| 4 | 鳥栖 | 66 | 111 | 33 | 12 | 21 | 86 | 76 | 10 |
| 5 | 湘南 | 67 | 90 | 26 | 12 | 29 | 91 | 96 | -5 |
| 6 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 7 | C大阪 | 52 | 86 | 26 | 8 | 18 | 77 | 60 | 17 |
| 8 | 山形 | 65 | 79 | 20 | 19 | 26 | 74 | 77 | -3 |
| 9 | 福岡 | 51 | 77 | 23 | 8 | 20 | 81 | 65 | 16 |
| 10 | 愛媛 | 67 | 74 | 20 | 14 | 33 | 66 | 89 | -23 |
| 11 | 群馬 | 67 | 58 | 10 | 28 | 29 | 59 | 102 | -43 |
| 12 | 水戸 | 67 | 49 | 12 | 13 | 42 | 51 | 101 | -50 |
| 13 | 徳島 | 67 | 45 | 8 | 21 | 38 | 48 | 108 | -60 |
| 14 | 横浜F | 19 | 38 | 11 | 5 | 3 | 28 | 16 | 12 |
| 15 | 柏 | 15 | 23 | 7 | 2 | 6 | 29 | 21 | 8 |
| 16 | 神戸 | 15 | 23 | 6 | 5 | 4 | 27 | 22 | 5 |
| 17 | 広島 | 4 | 10 | 3 | 1 | 0 | 9 | 2 | 7 |
| 18 | 岐阜 | 4 | 7 | 2 | 1 | 1 | 8 | 6 | 2 |
| 19 | 甲府 | 4 | 3 | 0 | 3 | 1 | 3 | 4 | -1 |
| 20 | 熊本 | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 3 | 5 | -2 |
