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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 62 | 116 | 34 | 14 | 14 | 93 | 61 | 32 |
| 2 | 仙台 | 65 | 112 | 32 | 16 | 17 | 96 | 70 | 26 |
| 3 | 東京V | 61 | 111 | 32 | 15 | 14 | 113 | 79 | 34 |
| 4 | 鳥栖 | 64 | 107 | 32 | 11 | 21 | 84 | 76 | 8 |
| 5 | 湘南 | 65 | 87 | 25 | 12 | 28 | 89 | 92 | -3 |
| 6 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 7 | C大阪 | 51 | 83 | 25 | 8 | 18 | 75 | 59 | 16 |
| 8 | 山形 | 64 | 78 | 20 | 18 | 26 | 74 | 77 | -3 |
| 9 | 福岡 | 50 | 76 | 23 | 7 | 20 | 79 | 63 | 16 |
| 10 | 愛媛 | 65 | 73 | 20 | 13 | 32 | 62 | 84 | -22 |
| 11 | 群馬 | 65 | 52 | 8 | 28 | 29 | 54 | 100 | -46 |
| 12 | 水戸 | 65 | 48 | 12 | 12 | 41 | 48 | 96 | -48 |
| 13 | 徳島 | 65 | 44 | 8 | 20 | 37 | 44 | 103 | -59 |
| 14 | 横浜F | 17 | 37 | 11 | 4 | 2 | 28 | 15 | 13 |
| 15 | 神戸 | 14 | 20 | 5 | 5 | 4 | 26 | 22 | 4 |
| 16 | 柏 | 14 | 20 | 6 | 2 | 6 | 25 | 21 | 4 |
| 17 | 広島 | 3 | 9 | 3 | 0 | 0 | 7 | 0 | 7 |
| 18 | 岐阜 | 3 | 4 | 1 | 1 | 1 | 6 | 5 | 1 |
| 19 | 熊本 | 2 | 3 | 1 | 0 | 1 | 3 | 3 | 0 |
| 20 | 甲府 | 3 | 2 | 0 | 2 | 1 | 1 | 2 | -1 |
