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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 64 | 117 | 34 | 15 | 15 | 94 | 63 | 31 |
| 2 | 東京V | 64 | 114 | 33 | 15 | 16 | 118 | 84 | 34 |
| 3 | 仙台 | 66 | 110 | 31 | 17 | 18 | 96 | 72 | 24 |
| 4 | 鳥栖 | 66 | 110 | 33 | 11 | 22 | 87 | 78 | 9 |
| 5 | 湘南 | 67 | 93 | 27 | 12 | 28 | 93 | 96 | -3 |
| 6 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 7 | C大阪 | 50 | 83 | 25 | 8 | 17 | 75 | 58 | 17 |
| 8 | 山形 | 66 | 82 | 21 | 19 | 26 | 72 | 74 | -2 |
| 9 | 福岡 | 49 | 76 | 23 | 7 | 19 | 79 | 62 | 17 |
| 10 | 愛媛 | 67 | 71 | 19 | 14 | 34 | 64 | 92 | -28 |
| 11 | 群馬 | 67 | 57 | 10 | 27 | 30 | 59 | 103 | -44 |
| 12 | 水戸 | 66 | 48 | 12 | 12 | 42 | 50 | 99 | -49 |
| 13 | 徳島 | 67 | 45 | 8 | 21 | 38 | 48 | 106 | -58 |
| 14 | 横浜F | 19 | 40 | 12 | 4 | 3 | 31 | 18 | 13 |
| 15 | 神戸 | 17 | 29 | 8 | 5 | 4 | 30 | 23 | 7 |
| 16 | 柏 | 17 | 26 | 8 | 2 | 7 | 33 | 26 | 7 |
| 17 | 広島 | 2 | 6 | 2 | 0 | 0 | 5 | 0 | 5 |
| 18 | 熊本 | 2 | 3 | 1 | 0 | 1 | 3 | 3 | 0 |
| 19 | 甲府 | 2 | 2 | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 |
| 20 | 岐阜 | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 2 | -1 |
