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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 64 | 108 | 30 | 18 | 16 | 93 | 69 | 24 |
| 2 | 札幌 | 55 | 104 | 31 | 11 | 13 | 76 | 54 | 22 |
| 3 | 鳥栖 | 64 | 102 | 30 | 12 | 22 | 84 | 81 | 3 |
| 4 | 東京V | 55 | 98 | 28 | 14 | 13 | 100 | 70 | 30 |
| 5 | C大阪 | 58 | 96 | 29 | 9 | 20 | 87 | 69 | 18 |
| 6 | 湘南 | 63 | 93 | 28 | 9 | 26 | 91 | 81 | 10 |
| 7 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 8 | 山形 | 63 | 86 | 23 | 17 | 23 | 72 | 69 | 3 |
| 9 | 福岡 | 57 | 85 | 25 | 10 | 22 | 88 | 74 | 14 |
| 10 | 愛媛 | 63 | 60 | 16 | 12 | 35 | 56 | 89 | -33 |
| 11 | 群馬 | 64 | 52 | 8 | 28 | 28 | 55 | 98 | -43 |
| 12 | 水戸 | 63 | 49 | 11 | 16 | 36 | 52 | 97 | -45 |
| 13 | 徳島 | 64 | 49 | 10 | 19 | 35 | 49 | 96 | -47 |
| 14 | 横浜F | 16 | 28 | 7 | 7 | 2 | 22 | 15 | 7 |
| 15 | 広島 | 9 | 20 | 6 | 2 | 1 | 21 | 8 | 13 |
| 16 | 岐阜 | 10 | 14 | 4 | 2 | 4 | 21 | 17 | 4 |
| 17 | 甲府 | 10 | 13 | 3 | 4 | 3 | 10 | 10 | 0 |
| 18 | 柏 | 6 | 10 | 3 | 1 | 2 | 14 | 11 | 3 |
| 19 | 熊本 | 9 | 8 | 2 | 2 | 5 | 10 | 14 | -4 |
| 20 | 神戸 | 7 | 6 | 1 | 3 | 3 | 12 | 12 | 0 |
