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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 68 | 121 | 35 | 16 | 17 | 98 | 70 | 28 |
| 2 | 東京V | 68 | 118 | 34 | 16 | 18 | 122 | 93 | 29 |
| 3 | 鳥栖 | 69 | 116 | 35 | 11 | 23 | 93 | 81 | 12 |
| 4 | 仙台 | 69 | 110 | 31 | 17 | 21 | 99 | 78 | 21 |
| 5 | 湘南 | 69 | 99 | 29 | 12 | 28 | 100 | 96 | 4 |
| 6 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 7 | C大阪 | 49 | 83 | 25 | 8 | 16 | 74 | 55 | 19 |
| 8 | 山形 | 69 | 83 | 21 | 20 | 28 | 74 | 79 | -5 |
| 9 | 愛媛 | 69 | 77 | 21 | 14 | 34 | 69 | 91 | -22 |
| 10 | 福岡 | 48 | 73 | 22 | 7 | 19 | 77 | 61 | 16 |
| 11 | 群馬 | 70 | 63 | 11 | 30 | 29 | 62 | 104 | -42 |
| 12 | 水戸 | 69 | 48 | 12 | 12 | 45 | 53 | 106 | -53 |
| 13 | 徳島 | 70 | 48 | 9 | 21 | 40 | 51 | 111 | -60 |
| 14 | 横浜F | 22 | 47 | 14 | 5 | 3 | 36 | 20 | 16 |
| 15 | 神戸 | 20 | 36 | 10 | 6 | 4 | 33 | 24 | 9 |
| 16 | 柏 | 21 | 33 | 10 | 3 | 8 | 39 | 33 | 6 |
| 17 | 広島 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 2 | 0 | 2 |
| 18 | 岐阜 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 |
| 18 | 甲府 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 |
| 20 | 熊本 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | -1 |
