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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 98 | 169 | 49 | 22 | 27 | 147 | 113 | 34 |
| 2 | 仙台 | 99 | 161 | 45 | 26 | 28 | 148 | 100 | 48 |
| 3 | 東京V | 96 | 160 | 47 | 19 | 30 | 159 | 132 | 27 |
| 4 | 鳥栖 | 99 | 154 | 44 | 22 | 33 | 128 | 118 | 10 |
| 5 | 湘南 | 99 | 132 | 38 | 18 | 43 | 139 | 145 | -6 |
| 6 | 山形 | 99 | 129 | 34 | 27 | 38 | 116 | 114 | 2 |
| 7 | 愛媛 | 97 | 101 | 27 | 20 | 50 | 92 | 130 | -38 |
| 8 | 横浜F | 51 | 99 | 28 | 15 | 8 | 67 | 37 | 30 |
| 9 | 京都 | 50 | 89 | 25 | 14 | 11 | 82 | 61 | 21 |
| 10 | 柏 | 48 | 88 | 27 | 7 | 14 | 84 | 60 | 24 |
| 11 | 水戸 | 99 | 88 | 23 | 19 | 57 | 81 | 142 | -61 |
| 12 | 神戸 | 48 | 86 | 25 | 11 | 12 | 78 | 53 | 25 |
| 13 | 群馬 | 99 | 84 | 16 | 36 | 47 | 98 | 164 | -66 |
| 14 | C大阪 | 49 | 83 | 25 | 8 | 16 | 74 | 55 | 19 |
| 15 | 福岡 | 50 | 77 | 23 | 8 | 19 | 83 | 62 | 21 |
| 16 | 徳島 | 99 | 71 | 15 | 26 | 58 | 76 | 163 | -87 |
| 17 | 甲府 | 3 | 4 | 1 | 1 | 1 | 3 | 7 | -4 |
| 18 | 広島 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 2 | 0 | 2 |
| 19 | 岐阜 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 |
| 20 | 熊本 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | -1 |
