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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 横浜F | 50 | 96 | 27 | 15 | 8 | 65 | 37 | 28 |
| 2 | 仙台 | 58 | 94 | 25 | 19 | 14 | 92 | 53 | 39 |
| 3 | 札幌 | 58 | 93 | 26 | 15 | 17 | 88 | 71 | 17 |
| 4 | 柏 | 48 | 88 | 27 | 7 | 14 | 84 | 60 | 24 |
| 5 | 神戸 | 48 | 86 | 25 | 11 | 12 | 78 | 53 | 25 |
| 6 | 鳥栖 | 57 | 86 | 24 | 14 | 19 | 71 | 64 | 7 |
| 7 | 東京V | 55 | 84 | 25 | 9 | 21 | 84 | 83 | 1 |
| 8 | 山形 | 57 | 82 | 22 | 16 | 19 | 78 | 62 | 16 |
| 9 | 湘南 | 57 | 61 | 16 | 13 | 28 | 71 | 96 | -25 |
| 10 | 愛媛 | 56 | 58 | 15 | 13 | 28 | 55 | 77 | -22 |
| 11 | 水戸 | 57 | 56 | 15 | 11 | 31 | 52 | 85 | -33 |
| 12 | 群馬 | 57 | 51 | 11 | 18 | 28 | 63 | 101 | -38 |
| 13 | 徳島 | 58 | 45 | 10 | 15 | 33 | 51 | 104 | -53 |
| 14 | 京都 | 10 | 18 | 5 | 3 | 2 | 15 | 9 | 6 |
| 15 | 福岡 | 9 | 15 | 4 | 3 | 2 | 20 | 8 | 12 |
| 16 | C大阪 | 7 | 9 | 3 | 0 | 4 | 9 | 9 | 0 |
| 17 | 甲府 | 2 | 3 | 1 | 0 | 1 | 2 | 6 | -4 |
