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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 51 | 94 | 28 | 10 | 13 | 70 | 53 | 17 |
| 2 | 東京V | 51 | 92 | 27 | 11 | 13 | 93 | 63 | 30 |
| 3 | 仙台 | 50 | 86 | 24 | 14 | 12 | 75 | 56 | 19 |
| 4 | 鳥栖 | 50 | 77 | 23 | 8 | 19 | 66 | 67 | -1 |
| 5 | 京都 | 42 | 75 | 21 | 12 | 9 | 71 | 51 | 20 |
| 6 | C大阪 | 42 | 69 | 21 | 6 | 15 | 59 | 50 | 9 |
| 7 | 山形 | 50 | 67 | 18 | 13 | 19 | 59 | 55 | 4 |
| 8 | 湘南 | 49 | 66 | 19 | 9 | 21 | 68 | 64 | 4 |
| 9 | 福岡 | 42 | 64 | 19 | 7 | 16 | 70 | 51 | 19 |
| 10 | 愛媛 | 49 | 53 | 14 | 11 | 24 | 45 | 64 | -19 |
| 11 | 群馬 | 49 | 41 | 7 | 20 | 22 | 39 | 76 | -37 |
| 12 | 徳島 | 50 | 38 | 7 | 17 | 26 | 36 | 71 | -35 |
| 13 | 水戸 | 50 | 36 | 8 | 12 | 30 | 36 | 75 | -39 |
| 14 | 横浜F | 8 | 17 | 5 | 2 | 1 | 13 | 6 | 7 |
| 15 | 柏 | 7 | 10 | 3 | 1 | 3 | 15 | 14 | 1 |
| 16 | 神戸 | 8 | 9 | 2 | 3 | 3 | 13 | 12 | 1 |
