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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 54 | 99 | 29 | 12 | 13 | 83 | 55 | 28 |
| 2 | 東京V | 53 | 95 | 28 | 11 | 14 | 97 | 70 | 27 |
| 3 | 仙台 | 54 | 90 | 25 | 15 | 14 | 81 | 63 | 18 |
| 4 | 鳥栖 | 53 | 82 | 24 | 10 | 19 | 67 | 67 | 0 |
| 5 | 湘南 | 54 | 72 | 20 | 12 | 22 | 75 | 74 | 1 |
| 6 | 京都 | 40 | 71 | 20 | 11 | 9 | 67 | 49 | 18 |
| 7 | 山形 | 54 | 71 | 18 | 17 | 19 | 65 | 59 | 6 |
| 8 | C大阪 | 40 | 68 | 21 | 5 | 14 | 56 | 46 | 10 |
| 9 | 福岡 | 41 | 64 | 19 | 7 | 15 | 70 | 50 | 20 |
| 10 | 愛媛 | 53 | 58 | 15 | 13 | 25 | 48 | 68 | -20 |
| 11 | 群馬 | 53 | 44 | 7 | 23 | 23 | 42 | 82 | -40 |
| 12 | 徳島 | 54 | 42 | 8 | 18 | 28 | 42 | 84 | -42 |
| 13 | 水戸 | 54 | 33 | 7 | 12 | 35 | 39 | 85 | -46 |
| 14 | 横浜F | 13 | 29 | 9 | 2 | 2 | 22 | 12 | 10 |
| 15 | 柏 | 13 | 20 | 6 | 2 | 5 | 25 | 19 | 6 |
| 16 | 神戸 | 13 | 19 | 5 | 4 | 4 | 25 | 21 | 4 |
