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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 50 | 97 | 28 | 13 | 9 | 79 | 45 | 34 |
| 2 | 鳥栖 | 49 | 83 | 25 | 8 | 16 | 64 | 58 | 6 |
| 3 | 仙台 | 49 | 82 | 23 | 13 | 13 | 78 | 60 | 18 |
| 4 | 東京V | 48 | 77 | 22 | 11 | 15 | 80 | 68 | 12 |
| 5 | 京都 | 34 | 62 | 18 | 8 | 8 | 59 | 42 | 17 |
| 6 | 湘南 | 49 | 62 | 18 | 8 | 23 | 64 | 71 | -7 |
| 7 | 山形 | 48 | 61 | 15 | 16 | 17 | 57 | 52 | 5 |
| 8 | 福岡 | 34 | 56 | 17 | 5 | 12 | 60 | 37 | 23 |
| 9 | 愛媛 | 49 | 54 | 14 | 12 | 23 | 44 | 62 | -18 |
| 10 | C大阪 | 34 | 52 | 16 | 4 | 14 | 44 | 42 | 2 |
| 11 | 群馬 | 49 | 43 | 8 | 19 | 22 | 42 | 77 | -35 |
| 12 | 徳島 | 49 | 37 | 7 | 16 | 26 | 40 | 80 | -40 |
| 13 | 水戸 | 49 | 35 | 8 | 11 | 30 | 38 | 77 | -39 |
| 14 | 横浜F | 15 | 30 | 9 | 3 | 3 | 23 | 14 | 9 |
| 15 | 柏 | 15 | 23 | 7 | 2 | 6 | 29 | 21 | 8 |
| 16 | 神戸 | 15 | 23 | 6 | 5 | 4 | 27 | 22 | 5 |
