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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 53 | 99 | 28 | 15 | 10 | 82 | 51 | 31 |
| 2 | 鳥栖 | 52 | 88 | 27 | 7 | 18 | 69 | 62 | 7 |
| 3 | 仙台 | 53 | 83 | 23 | 14 | 16 | 84 | 65 | 19 |
| 4 | 東京V | 53 | 83 | 24 | 11 | 18 | 88 | 78 | 10 |
| 5 | 山形 | 52 | 70 | 18 | 16 | 18 | 64 | 56 | 8 |
| 6 | 湘南 | 52 | 66 | 19 | 9 | 24 | 74 | 78 | -4 |
| 7 | 京都 | 30 | 58 | 17 | 7 | 6 | 52 | 34 | 18 |
| 8 | 愛媛 | 53 | 58 | 15 | 13 | 25 | 49 | 68 | -19 |
| 9 | 福岡 | 30 | 52 | 16 | 4 | 10 | 53 | 31 | 22 |
| 10 | 群馬 | 52 | 47 | 9 | 20 | 23 | 43 | 79 | -36 |
| 11 | 横浜F | 23 | 46 | 13 | 7 | 3 | 37 | 23 | 14 |
| 12 | C大阪 | 31 | 46 | 14 | 4 | 13 | 41 | 40 | 1 |
| 13 | 神戸 | 22 | 42 | 12 | 6 | 4 | 37 | 25 | 12 |
| 14 | 徳島 | 54 | 40 | 8 | 16 | 30 | 45 | 89 | -44 |
| 15 | 柏 | 22 | 36 | 11 | 3 | 8 | 41 | 34 | 7 |
| 16 | 水戸 | 52 | 31 | 7 | 10 | 35 | 42 | 88 | -46 |
