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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 64 | 114 | 32 | 18 | 14 | 102 | 76 | 26 |
| 2 | 鳥栖 | 63 | 103 | 30 | 13 | 20 | 85 | 77 | 8 |
| 3 | 仙台 | 64 | 100 | 28 | 16 | 20 | 101 | 75 | 26 |
| 4 | 山形 | 65 | 97 | 26 | 19 | 20 | 89 | 67 | 22 |
| 5 | 東京V | 64 | 96 | 28 | 12 | 24 | 101 | 95 | 6 |
| 6 | 湘南 | 64 | 76 | 22 | 10 | 32 | 89 | 99 | -10 |
| 7 | 神戸 | 35 | 69 | 20 | 9 | 6 | 64 | 38 | 26 |
| 8 | 愛媛 | 64 | 66 | 18 | 12 | 34 | 58 | 85 | -27 |
| 9 | 横浜F | 35 | 65 | 18 | 11 | 6 | 47 | 29 | 18 |
| 10 | 柏 | 35 | 60 | 18 | 6 | 11 | 62 | 49 | 13 |
| 11 | 京都 | 28 | 57 | 17 | 6 | 5 | 50 | 31 | 19 |
| 12 | 群馬 | 63 | 54 | 11 | 21 | 31 | 60 | 107 | -47 |
| 13 | 水戸 | 63 | 51 | 13 | 12 | 38 | 54 | 99 | -45 |
| 14 | 徳島 | 64 | 50 | 11 | 17 | 36 | 55 | 110 | -55 |
| 15 | 福岡 | 28 | 46 | 14 | 4 | 10 | 48 | 31 | 17 |
| 16 | C大阪 | 29 | 43 | 13 | 4 | 12 | 39 | 36 | 3 |
