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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 64 | 111 | 31 | 18 | 15 | 101 | 79 | 22 |
| 2 | 鳥栖 | 64 | 104 | 30 | 14 | 20 | 84 | 76 | 8 |
| 3 | 仙台 | 64 | 102 | 28 | 18 | 18 | 101 | 72 | 29 |
| 4 | 東京V | 64 | 94 | 27 | 13 | 24 | 96 | 95 | 1 |
| 5 | 山形 | 64 | 92 | 24 | 20 | 20 | 89 | 69 | 20 |
| 6 | 湘南 | 64 | 77 | 22 | 11 | 31 | 90 | 99 | -9 |
| 7 | 横浜F | 37 | 71 | 20 | 11 | 6 | 50 | 29 | 21 |
| 8 | 神戸 | 37 | 70 | 20 | 10 | 7 | 64 | 40 | 24 |
| 9 | 愛媛 | 64 | 67 | 18 | 13 | 33 | 60 | 86 | -26 |
| 10 | 柏 | 36 | 63 | 19 | 6 | 11 | 64 | 50 | 14 |
| 11 | 群馬 | 63 | 56 | 12 | 20 | 31 | 61 | 104 | -43 |
| 12 | 京都 | 27 | 54 | 16 | 6 | 5 | 48 | 30 | 18 |
| 13 | 水戸 | 63 | 52 | 14 | 10 | 39 | 57 | 101 | -44 |
| 14 | 徳島 | 64 | 51 | 11 | 18 | 35 | 55 | 108 | -53 |
| 15 | 福岡 | 26 | 40 | 12 | 4 | 10 | 41 | 29 | 12 |
| 16 | C大阪 | 27 | 40 | 12 | 4 | 11 | 35 | 29 | 6 |
