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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 43 | 83 | 24 | 11 | 8 | 66 | 37 | 29 |
| 2 | 鳥栖 | 43 | 74 | 23 | 5 | 15 | 57 | 52 | 5 |
| 3 | 仙台 | 43 | 71 | 20 | 11 | 12 | 72 | 53 | 19 |
| 4 | 東京V | 43 | 68 | 20 | 8 | 15 | 72 | 65 | 7 |
| 5 | 山形 | 43 | 58 | 15 | 13 | 15 | 55 | 46 | 9 |
| 6 | 湘南 | 44 | 55 | 16 | 7 | 21 | 62 | 68 | -6 |
| 7 | 愛媛 | 44 | 50 | 14 | 8 | 22 | 40 | 57 | -17 |
| 8 | 京都 | 25 | 48 | 14 | 6 | 5 | 45 | 29 | 16 |
| 9 | 福岡 | 25 | 40 | 12 | 4 | 9 | 41 | 28 | 13 |
| 10 | 群馬 | 43 | 40 | 8 | 16 | 19 | 36 | 64 | -28 |
| 11 | 横浜F | 19 | 38 | 11 | 5 | 3 | 29 | 18 | 11 |
| 12 | 徳島 | 44 | 36 | 7 | 15 | 22 | 38 | 73 | -35 |
| 13 | C大阪 | 25 | 34 | 10 | 4 | 11 | 31 | 28 | 3 |
| 14 | 神戸 | 18 | 32 | 9 | 5 | 4 | 31 | 23 | 8 |
| 15 | 柏 | 19 | 29 | 9 | 2 | 8 | 36 | 31 | 5 |
| 16 | 水戸 | 43 | 27 | 7 | 6 | 30 | 35 | 74 | -39 |
