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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 40 | 77 | 22 | 11 | 7 | 61 | 34 | 27 |
| 2 | 鳥栖 | 40 | 71 | 22 | 5 | 13 | 52 | 48 | 4 |
| 3 | 仙台 | 39 | 67 | 19 | 10 | 10 | 66 | 44 | 22 |
| 4 | 東京V | 39 | 61 | 18 | 7 | 14 | 63 | 59 | 4 |
| 5 | 山形 | 39 | 55 | 14 | 13 | 12 | 51 | 39 | 12 |
| 6 | 湘南 | 40 | 46 | 13 | 7 | 20 | 54 | 65 | -11 |
| 7 | 京都 | 24 | 45 | 13 | 6 | 5 | 43 | 28 | 15 |
| 8 | 愛媛 | 40 | 44 | 12 | 8 | 20 | 37 | 54 | -17 |
| 9 | 福岡 | 24 | 40 | 12 | 4 | 8 | 40 | 26 | 14 |
| 10 | 群馬 | 40 | 35 | 7 | 14 | 19 | 33 | 62 | -29 |
| 11 | 横浜F | 16 | 33 | 10 | 3 | 3 | 25 | 15 | 10 |
| 12 | 徳島 | 40 | 33 | 6 | 15 | 19 | 34 | 66 | -32 |
| 13 | C大阪 | 24 | 31 | 9 | 4 | 11 | 28 | 27 | 1 |
| 14 | 柏 | 16 | 26 | 8 | 2 | 6 | 32 | 22 | 10 |
| 15 | 神戸 | 16 | 26 | 7 | 5 | 4 | 29 | 23 | 6 |
| 16 | 水戸 | 39 | 24 | 6 | 6 | 27 | 32 | 68 | -36 |
