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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 69 | 120 | 35 | 15 | 19 | 107 | 80 | 27 |
| 2 | 仙台 | 69 | 113 | 31 | 20 | 18 | 112 | 66 | 46 |
| 3 | 鳥栖 | 69 | 109 | 31 | 16 | 22 | 87 | 79 | 8 |
| 4 | 東京V | 68 | 101 | 30 | 11 | 27 | 102 | 106 | -4 |
| 5 | 山形 | 68 | 98 | 26 | 20 | 22 | 93 | 76 | 17 |
| 6 | 横浜F | 49 | 93 | 26 | 15 | 8 | 62 | 36 | 26 |
| 7 | 柏 | 48 | 88 | 27 | 7 | 14 | 84 | 60 | 24 |
| 8 | 神戸 | 48 | 86 | 25 | 11 | 12 | 78 | 53 | 25 |
| 9 | 湘南 | 68 | 82 | 23 | 13 | 32 | 95 | 108 | -13 |
| 10 | 愛媛 | 67 | 70 | 19 | 13 | 35 | 64 | 90 | -26 |
| 11 | 群馬 | 68 | 64 | 14 | 22 | 32 | 71 | 112 | -41 |
| 12 | 水戸 | 68 | 64 | 17 | 13 | 38 | 61 | 103 | -42 |
| 13 | 徳島 | 69 | 53 | 11 | 20 | 38 | 58 | 116 | -58 |
| 14 | 京都 | 20 | 32 | 9 | 5 | 6 | 28 | 25 | 3 |
| 15 | 福岡 | 20 | 28 | 8 | 4 | 8 | 32 | 26 | 6 |
| 16 | C大阪 | 19 | 24 | 7 | 3 | 9 | 24 | 23 | 1 |
| 17 | 甲府 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 2 | 1 | 1 |
