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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 100 | 164 | 45 | 29 | 26 | 163 | 98 | 65 |
| 2 | 札幌 | 100 | 155 | 43 | 26 | 31 | 140 | 125 | 15 |
| 3 | 山形 | 100 | 146 | 38 | 32 | 30 | 134 | 108 | 26 |
| 4 | 鳥栖 | 100 | 136 | 38 | 22 | 40 | 131 | 130 | 1 |
| 5 | 横浜F | 88 | 133 | 35 | 28 | 25 | 107 | 93 | 14 |
| 6 | 湘南 | 100 | 114 | 29 | 27 | 44 | 116 | 154 | -38 |
| 7 | 水戸 | 100 | 109 | 28 | 25 | 47 | 92 | 135 | -43 |
| 8 | 京都 | 52 | 105 | 31 | 12 | 9 | 95 | 48 | 47 |
| 9 | 福岡 | 52 | 94 | 26 | 16 | 10 | 88 | 50 | 38 |
| 10 | 徳島 | 100 | 91 | 20 | 31 | 49 | 104 | 175 | -71 |
| 11 | 柏 | 48 | 88 | 27 | 7 | 14 | 84 | 60 | 24 |
| 12 | 神戸 | 48 | 86 | 25 | 11 | 12 | 78 | 53 | 25 |
| 13 | 東京V | 60 | 84 | 25 | 9 | 26 | 89 | 100 | -11 |
| 14 | 群馬 | 100 | 81 | 18 | 27 | 55 | 90 | 173 | -83 |
| 15 | 甲府 | 40 | 64 | 18 | 10 | 12 | 70 | 57 | 13 |
| 16 | 愛媛 | 60 | 61 | 16 | 13 | 31 | 58 | 80 | -22 |
| 17 | C大阪 | 12 | 15 | 4 | 3 | 5 | 14 | 14 | 0 |
