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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 72 | 144 | 44 | 12 | 16 | 131 | 77 | 54 |
| 2 | 福岡 | 72 | 130 | 38 | 16 | 18 | 107 | 70 | 37 |
| 3 | 仙台 | 79 | 119 | 32 | 23 | 24 | 117 | 85 | 32 |
| 4 | 山形 | 79 | 114 | 29 | 27 | 23 | 98 | 87 | 11 |
| 5 | 甲府 | 72 | 104 | 28 | 20 | 24 | 107 | 92 | 15 |
| 6 | 札幌 | 79 | 96 | 25 | 21 | 33 | 79 | 101 | -22 |
| 7 | 横浜F | 79 | 90 | 21 | 27 | 31 | 79 | 102 | -23 |
| 8 | 湘南 | 79 | 86 | 20 | 26 | 33 | 77 | 104 | -27 |
| 9 | 水戸 | 80 | 82 | 18 | 28 | 34 | 66 | 103 | -37 |
| 10 | 鳥栖 | 80 | 74 | 19 | 17 | 44 | 78 | 116 | -38 |
| 11 | 大宮 | 28 | 67 | 21 | 4 | 3 | 45 | 19 | 26 |
| 12 | 川崎 | 28 | 63 | 20 | 3 | 5 | 70 | 27 | 43 |
| 13 | 徳島 | 51 | 60 | 14 | 18 | 19 | 68 | 87 | -19 |
| 14 | 群馬 | 51 | 30 | 7 | 9 | 35 | 33 | 94 | -61 |
| 15 | 柏 | 8 | 19 | 6 | 1 | 1 | 13 | 5 | 8 |
| 16 | 東京V | 7 | 15 | 5 | 0 | 2 | 13 | 9 | 4 |
| 17 | 神戸 | 8 | 10 | 3 | 1 | 4 | 9 | 10 | -1 |
| 18 | 愛媛 | 8 | 10 | 3 | 1 | 4 | 6 | 8 | -2 |
