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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 94 | 148 | 41 | 25 | 28 | 144 | 92 | 52 |
| 2 | 横浜F | 94 | 139 | 36 | 31 | 27 | 111 | 100 | 11 |
| 3 | 札幌 | 94 | 134 | 36 | 26 | 32 | 129 | 124 | 5 |
| 4 | 鳥栖 | 94 | 129 | 35 | 24 | 35 | 122 | 114 | 8 |
| 5 | 山形 | 94 | 125 | 31 | 32 | 31 | 116 | 109 | 7 |
| 6 | 京都 | 48 | 106 | 33 | 7 | 8 | 94 | 43 | 51 |
| 7 | 湘南 | 94 | 106 | 27 | 25 | 42 | 110 | 146 | -36 |
| 8 | 水戸 | 94 | 103 | 27 | 22 | 45 | 91 | 129 | -38 |
| 9 | 福岡 | 48 | 90 | 25 | 15 | 8 | 80 | 46 | 34 |
| 10 | 徳島 | 91 | 87 | 20 | 27 | 44 | 103 | 163 | -60 |
| 11 | 神戸 | 46 | 85 | 25 | 10 | 11 | 75 | 49 | 26 |
| 12 | 柏 | 46 | 85 | 26 | 7 | 13 | 79 | 57 | 22 |
| 13 | 甲府 | 48 | 70 | 19 | 13 | 16 | 80 | 70 | 10 |
| 14 | 東京V | 46 | 69 | 21 | 6 | 19 | 67 | 73 | -6 |
| 15 | 群馬 | 90 | 63 | 14 | 21 | 55 | 78 | 166 | -88 |
| 16 | 愛媛 | 47 | 53 | 14 | 11 | 22 | 51 | 61 | -10 |
| 17 | 大宮 | 4 | 12 | 4 | 0 | 0 | 7 | 1 | 6 |
| 18 | 川崎 | 4 | 9 | 3 | 0 | 1 | 10 | 4 | 6 |
