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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 横浜F | 64 | 106 | 29 | 19 | 16 | 83 | 64 | 19 |
| 2 | 仙台 | 64 | 103 | 28 | 19 | 17 | 95 | 56 | 39 |
| 3 | 鳥栖 | 64 | 94 | 26 | 16 | 22 | 86 | 75 | 11 |
| 4 | 札幌 | 64 | 92 | 25 | 17 | 22 | 96 | 92 | 4 |
| 5 | 柏 | 45 | 85 | 26 | 7 | 12 | 79 | 56 | 23 |
| 6 | 神戸 | 45 | 84 | 25 | 9 | 11 | 74 | 48 | 26 |
| 7 | 山形 | 64 | 83 | 21 | 20 | 23 | 79 | 77 | 2 |
| 8 | 水戸 | 65 | 74 | 20 | 14 | 31 | 62 | 86 | -24 |
| 9 | 湘南 | 64 | 70 | 18 | 16 | 30 | 77 | 103 | -26 |
| 10 | 東京V | 45 | 69 | 21 | 6 | 18 | 67 | 71 | -4 |
| 11 | 徳島 | 65 | 58 | 15 | 13 | 37 | 70 | 126 | -56 |
| 12 | 愛媛 | 46 | 53 | 14 | 11 | 21 | 51 | 59 | -8 |
| 13 | 群馬 | 64 | 46 | 10 | 16 | 38 | 59 | 118 | -59 |
| 14 | 京都 | 19 | 40 | 12 | 4 | 3 | 45 | 14 | 31 |
| 15 | 福岡 | 19 | 35 | 10 | 5 | 4 | 34 | 19 | 15 |
| 16 | 甲府 | 19 | 33 | 9 | 6 | 4 | 35 | 28 | 7 |
