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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 横浜F | 57 | 98 | 27 | 17 | 13 | 74 | 50 | 24 |
| 2 | 仙台 | 57 | 97 | 27 | 16 | 14 | 88 | 47 | 41 |
| 3 | 鳥栖 | 57 | 86 | 24 | 14 | 19 | 73 | 65 | 8 |
| 4 | 神戸 | 44 | 84 | 25 | 9 | 10 | 73 | 46 | 27 |
| 5 | 柏 | 44 | 82 | 25 | 7 | 12 | 77 | 55 | 22 |
| 6 | 札幌 | 57 | 80 | 21 | 17 | 19 | 90 | 86 | 4 |
| 7 | 山形 | 58 | 73 | 19 | 16 | 23 | 73 | 75 | -2 |
| 8 | 水戸 | 58 | 68 | 19 | 11 | 28 | 58 | 77 | -19 |
| 9 | 東京V | 44 | 66 | 20 | 6 | 18 | 64 | 69 | -5 |
| 10 | 湘南 | 57 | 64 | 17 | 13 | 27 | 71 | 93 | -22 |
| 11 | 愛媛 | 45 | 50 | 13 | 11 | 21 | 49 | 59 | -10 |
| 12 | 徳島 | 58 | 48 | 12 | 12 | 34 | 60 | 116 | -56 |
| 13 | 群馬 | 57 | 41 | 9 | 14 | 34 | 56 | 106 | -50 |
| 14 | 京都 | 13 | 29 | 9 | 2 | 2 | 31 | 9 | 22 |
| 15 | 福岡 | 13 | 24 | 7 | 3 | 3 | 26 | 14 | 12 |
| 16 | 甲府 | 13 | 22 | 6 | 4 | 3 | 25 | 21 | 4 |
