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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 横浜F | 66 | 109 | 30 | 19 | 17 | 85 | 66 | 19 |
| 2 | 仙台 | 66 | 107 | 29 | 20 | 17 | 98 | 58 | 40 |
| 3 | 鳥栖 | 66 | 97 | 27 | 16 | 23 | 87 | 76 | 11 |
| 4 | 札幌 | 66 | 93 | 25 | 18 | 23 | 99 | 96 | 3 |
| 5 | 山形 | 67 | 89 | 23 | 20 | 24 | 83 | 80 | 3 |
| 6 | 神戸 | 44 | 84 | 25 | 9 | 10 | 73 | 46 | 27 |
| 7 | 柏 | 44 | 82 | 25 | 7 | 12 | 77 | 55 | 22 |
| 8 | 水戸 | 67 | 75 | 20 | 15 | 32 | 63 | 90 | -27 |
| 9 | 湘南 | 66 | 73 | 19 | 16 | 31 | 79 | 106 | -27 |
| 10 | 東京V | 44 | 66 | 20 | 6 | 18 | 64 | 69 | -5 |
| 11 | 徳島 | 67 | 60 | 15 | 15 | 37 | 72 | 128 | -56 |
| 12 | 愛媛 | 45 | 50 | 13 | 11 | 21 | 49 | 59 | -10 |
| 13 | 群馬 | 66 | 49 | 11 | 16 | 39 | 60 | 118 | -58 |
| 14 | 京都 | 22 | 43 | 13 | 4 | 5 | 49 | 19 | 30 |
| 15 | 福岡 | 22 | 42 | 12 | 6 | 4 | 41 | 21 | 20 |
| 16 | 甲府 | 22 | 39 | 11 | 6 | 5 | 40 | 32 | 8 |
