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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 横浜F | 65 | 109 | 30 | 19 | 16 | 84 | 64 | 20 |
| 2 | 仙台 | 66 | 107 | 29 | 20 | 17 | 98 | 58 | 40 |
| 3 | 鳥栖 | 65 | 94 | 26 | 16 | 23 | 85 | 75 | 10 |
| 4 | 札幌 | 65 | 92 | 25 | 17 | 23 | 98 | 95 | 3 |
| 5 | 山形 | 66 | 86 | 22 | 20 | 24 | 80 | 80 | 0 |
| 6 | 神戸 | 43 | 84 | 25 | 9 | 9 | 70 | 42 | 28 |
| 7 | 柏 | 43 | 79 | 24 | 7 | 12 | 73 | 52 | 21 |
| 8 | 湘南 | 65 | 73 | 19 | 16 | 30 | 78 | 104 | -26 |
| 9 | 水戸 | 66 | 72 | 19 | 15 | 32 | 61 | 89 | -28 |
| 10 | 東京V | 43 | 63 | 19 | 6 | 18 | 62 | 68 | -6 |
| 11 | 徳島 | 66 | 60 | 15 | 15 | 36 | 71 | 126 | -55 |
| 12 | 愛媛 | 44 | 49 | 13 | 10 | 21 | 48 | 58 | -10 |
| 13 | 群馬 | 65 | 49 | 11 | 16 | 38 | 60 | 115 | -55 |
| 14 | 京都 | 22 | 43 | 13 | 4 | 5 | 49 | 19 | 30 |
| 15 | 福岡 | 22 | 42 | 12 | 6 | 4 | 41 | 21 | 20 |
| 16 | 甲府 | 22 | 39 | 11 | 6 | 5 | 40 | 32 | 8 |
