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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 61 | 101 | 28 | 17 | 16 | 94 | 54 | 40 |
| 2 | 横浜F | 60 | 99 | 27 | 18 | 15 | 76 | 58 | 18 |
| 3 | 鳥栖 | 60 | 85 | 23 | 16 | 21 | 77 | 70 | 7 |
| 4 | 札幌 | 60 | 85 | 23 | 16 | 21 | 91 | 87 | 4 |
| 5 | 神戸 | 41 | 80 | 24 | 8 | 9 | 66 | 41 | 25 |
| 6 | 山形 | 61 | 79 | 20 | 19 | 22 | 75 | 74 | 1 |
| 7 | 柏 | 42 | 78 | 24 | 6 | 12 | 70 | 49 | 21 |
| 8 | 湘南 | 61 | 70 | 18 | 16 | 27 | 76 | 98 | -22 |
| 9 | 水戸 | 61 | 67 | 18 | 13 | 30 | 56 | 83 | -27 |
| 10 | 東京V | 41 | 62 | 19 | 5 | 17 | 59 | 62 | -3 |
| 11 | 徳島 | 61 | 54 | 14 | 12 | 35 | 64 | 119 | -55 |
| 12 | 群馬 | 60 | 46 | 10 | 16 | 34 | 56 | 105 | -49 |
| 13 | 愛媛 | 42 | 45 | 12 | 9 | 21 | 43 | 56 | -13 |
| 14 | 京都 | 19 | 40 | 12 | 4 | 3 | 45 | 14 | 31 |
| 15 | 福岡 | 19 | 35 | 10 | 5 | 4 | 34 | 19 | 15 |
| 16 | 甲府 | 19 | 33 | 9 | 6 | 4 | 35 | 28 | 7 |
