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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 60 | 100 | 28 | 16 | 16 | 93 | 53 | 40 |
| 2 | 横浜F | 59 | 96 | 26 | 18 | 15 | 73 | 58 | 15 |
| 3 | 札幌 | 59 | 85 | 23 | 16 | 20 | 91 | 84 | 7 |
| 4 | 鳥栖 | 59 | 82 | 22 | 16 | 21 | 76 | 70 | 6 |
| 5 | 山形 | 60 | 79 | 20 | 19 | 21 | 75 | 73 | 2 |
| 6 | 柏 | 41 | 78 | 24 | 6 | 11 | 69 | 46 | 23 |
| 7 | 神戸 | 40 | 77 | 23 | 8 | 9 | 65 | 41 | 24 |
| 8 | 湘南 | 60 | 70 | 18 | 16 | 26 | 75 | 95 | -20 |
| 9 | 水戸 | 60 | 67 | 18 | 13 | 29 | 56 | 82 | -26 |
| 10 | 東京V | 40 | 59 | 18 | 5 | 17 | 56 | 61 | -5 |
| 11 | 徳島 | 60 | 53 | 14 | 11 | 35 | 63 | 118 | -55 |
| 12 | 群馬 | 60 | 46 | 10 | 16 | 34 | 56 | 105 | -49 |
| 13 | 愛媛 | 41 | 42 | 11 | 9 | 21 | 40 | 55 | -15 |
| 14 | 京都 | 19 | 40 | 12 | 4 | 3 | 45 | 14 | 31 |
| 15 | 福岡 | 19 | 35 | 10 | 5 | 4 | 34 | 19 | 15 |
| 16 | 甲府 | 19 | 33 | 9 | 6 | 4 | 35 | 28 | 7 |
