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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 50 | 86 | 24 | 14 | 12 | 76 | 39 | 37 |
| 2 | 横浜F | 49 | 75 | 20 | 15 | 14 | 58 | 48 | 10 |
| 3 | 札幌 | 50 | 72 | 20 | 12 | 18 | 72 | 77 | -5 |
| 4 | 山形 | 50 | 71 | 19 | 14 | 17 | 66 | 60 | 6 |
| 5 | 鳥栖 | 50 | 62 | 16 | 14 | 20 | 62 | 63 | -1 |
| 6 | 水戸 | 50 | 61 | 16 | 13 | 21 | 46 | 66 | -20 |
| 7 | 柏 | 29 | 59 | 18 | 5 | 6 | 48 | 29 | 19 |
| 8 | 湘南 | 49 | 55 | 14 | 13 | 22 | 60 | 75 | -15 |
| 9 | 神戸 | 30 | 54 | 16 | 6 | 8 | 47 | 30 | 17 |
| 10 | 徳島 | 49 | 48 | 13 | 9 | 27 | 53 | 92 | -39 |
| 11 | 東京V | 30 | 45 | 14 | 3 | 13 | 40 | 44 | -4 |
| 12 | 京都 | 20 | 43 | 13 | 4 | 3 | 47 | 15 | 32 |
| 13 | 福岡 | 20 | 38 | 11 | 5 | 4 | 37 | 19 | 18 |
| 14 | 甲府 | 20 | 33 | 9 | 6 | 5 | 36 | 30 | 6 |
| 15 | 群馬 | 49 | 32 | 7 | 11 | 31 | 45 | 93 | -48 |
| 16 | 愛媛 | 29 | 27 | 7 | 6 | 16 | 27 | 40 | -13 |
