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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 大分 | 93 | 179 | 55 | 14 | 24 | 158 | 92 | 66 |
| 2 | 新潟 | 94 | 172 | 52 | 16 | 26 | 158 | 101 | 57 |
| 3 | 大宮 | 93 | 155 | 45 | 20 | 28 | 130 | 91 | 39 |
| 4 | 山形 | 93 | 128 | 36 | 20 | 37 | 98 | 99 | -1 |
| 5 | 川崎 | 77 | 123 | 37 | 12 | 28 | 123 | 100 | 23 |
| 6 | 湘南 | 94 | 121 | 35 | 16 | 43 | 120 | 134 | -14 |
| 7 | 仙台 | 61 | 111 | 35 | 6 | 20 | 104 | 88 | 16 |
| 8 | 京都 | 44 | 89 | 28 | 5 | 11 | 79 | 48 | 31 |
| 9 | 甲府 | 93 | 84 | 24 | 12 | 57 | 85 | 166 | -81 |
| 10 | 水戸 | 94 | 80 | 23 | 11 | 60 | 92 | 174 | -82 |
| 11 | 鳥栖 | 93 | 79 | 21 | 16 | 56 | 91 | 152 | -61 |
| 12 | 横浜F | 77 | 72 | 21 | 9 | 47 | 90 | 138 | -48 |
| 13 | C大阪 | 33 | 66 | 19 | 9 | 5 | 67 | 40 | 27 |
| 14 | 福岡 | 33 | 37 | 9 | 10 | 14 | 42 | 42 | 0 |
| 15 | 札幌 | 16 | 36 | 11 | 3 | 2 | 27 | 9 | 18 |
| 16 | 浦和 | 16 | 34 | 11 | 1 | 4 | 25 | 15 | 10 |
