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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 大分 | 83 | 164 | 51 | 11 | 21 | 145 | 81 | 64 |
| 2 | 新潟 | 84 | 154 | 47 | 13 | 24 | 144 | 91 | 53 |
| 3 | 大宮 | 83 | 146 | 44 | 14 | 25 | 121 | 79 | 42 |
| 4 | 山形 | 83 | 117 | 34 | 15 | 34 | 93 | 94 | -1 |
| 5 | 仙台 | 61 | 111 | 35 | 6 | 20 | 104 | 88 | 16 |
| 6 | 川崎 | 67 | 104 | 32 | 8 | 27 | 103 | 89 | 14 |
| 7 | 湘南 | 84 | 104 | 30 | 14 | 40 | 109 | 123 | -14 |
| 8 | 京都 | 44 | 89 | 28 | 5 | 11 | 79 | 48 | 31 |
| 9 | 鳥栖 | 83 | 73 | 20 | 13 | 50 | 84 | 137 | -53 |
| 10 | 水戸 | 84 | 70 | 20 | 10 | 54 | 80 | 158 | -78 |
| 11 | 横浜F | 67 | 64 | 19 | 7 | 41 | 79 | 120 | -41 |
| 12 | 甲府 | 83 | 63 | 18 | 9 | 56 | 72 | 159 | -87 |
| 13 | C大阪 | 23 | 45 | 13 | 6 | 4 | 50 | 31 | 19 |
| 14 | 札幌 | 16 | 36 | 11 | 3 | 2 | 27 | 9 | 18 |
| 15 | 浦和 | 16 | 34 | 11 | 1 | 4 | 25 | 15 | 10 |
| 16 | 福岡 | 23 | 31 | 8 | 7 | 8 | 34 | 27 | 7 |
