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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 大分 | 99 | 198 | 62 | 12 | 25 | 174 | 93 | 81 |
| 2 | 新潟 | 100 | 173 | 53 | 14 | 33 | 166 | 116 | 50 |
| 3 | 大宮 | 99 | 171 | 52 | 15 | 32 | 142 | 102 | 40 |
| 4 | 仙台 | 78 | 142 | 45 | 7 | 26 | 132 | 114 | 18 |
| 5 | 山形 | 100 | 135 | 40 | 15 | 45 | 110 | 118 | -8 |
| 6 | 湘南 | 100 | 125 | 37 | 14 | 49 | 132 | 146 | -14 |
| 7 | 川崎 | 66 | 101 | 31 | 8 | 27 | 102 | 89 | 13 |
| 8 | 鳥栖 | 99 | 94 | 26 | 16 | 57 | 100 | 152 | -52 |
| 9 | 京都 | 44 | 89 | 28 | 5 | 11 | 79 | 48 | 31 |
| 10 | 水戸 | 100 | 89 | 26 | 11 | 63 | 95 | 181 | -86 |
| 11 | 札幌 | 34 | 84 | 27 | 3 | 4 | 58 | 20 | 38 |
| 12 | 浦和 | 33 | 68 | 22 | 2 | 9 | 61 | 36 | 25 |
| 13 | 横浜F | 66 | 64 | 19 | 7 | 40 | 79 | 119 | -40 |
| 14 | 甲府 | 100 | 64 | 18 | 10 | 72 | 83 | 199 | -116 |
| 15 | C大阪 | 22 | 42 | 12 | 6 | 4 | 47 | 31 | 16 |
| 16 | 福岡 | 22 | 28 | 7 | 7 | 8 | 31 | 27 | 4 |
