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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 大分 | 118 | 238 | 75 | 13 | 30 | 216 | 116 | 100 |
| 2 | 大宮 | 118 | 207 | 64 | 15 | 39 | 164 | 124 | 40 |
| 3 | 新潟 | 118 | 199 | 62 | 13 | 43 | 188 | 147 | 41 |
| 4 | 仙台 | 97 | 163 | 51 | 10 | 36 | 148 | 136 | 12 |
| 5 | 山形 | 118 | 155 | 46 | 17 | 55 | 135 | 151 | -16 |
| 6 | 湘南 | 105 | 137 | 41 | 14 | 50 | 144 | 154 | -10 |
| 7 | 川崎 | 78 | 126 | 39 | 9 | 30 | 125 | 102 | 23 |
| 8 | 札幌 | 53 | 116 | 37 | 5 | 11 | 85 | 33 | 52 |
| 9 | 鳥栖 | 118 | 112 | 32 | 16 | 70 | 120 | 185 | -65 |
| 10 | 水戸 | 105 | 98 | 29 | 11 | 65 | 99 | 185 | -86 |
| 11 | 京都 | 44 | 89 | 28 | 5 | 11 | 79 | 48 | 31 |
| 12 | 浦和 | 40 | 87 | 28 | 3 | 9 | 82 | 40 | 42 |
| 13 | 甲府 | 118 | 67 | 19 | 10 | 89 | 96 | 247 | -151 |
| 14 | 横浜F | 65 | 64 | 19 | 7 | 39 | 78 | 115 | -37 |
| 15 | C大阪 | 21 | 39 | 11 | 6 | 4 | 45 | 30 | 15 |
| 16 | 福岡 | 21 | 28 | 7 | 7 | 7 | 30 | 25 | 5 |
| 17 | F東京 | 13 | 19 | 6 | 1 | 6 | 19 | 15 | 4 |
