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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 大分 | 100 | 203 | 64 | 11 | 25 | 178 | 93 | 85 |
| 2 | 大宮 | 100 | 176 | 54 | 14 | 32 | 143 | 100 | 43 |
| 3 | 新潟 | 100 | 169 | 52 | 13 | 35 | 166 | 123 | 43 |
| 4 | 仙台 | 80 | 145 | 46 | 7 | 27 | 136 | 117 | 19 |
| 5 | 山形 | 101 | 136 | 41 | 13 | 47 | 113 | 122 | -9 |
| 6 | 湘南 | 100 | 127 | 38 | 13 | 49 | 132 | 148 | -16 |
| 7 | 川崎 | 64 | 97 | 30 | 7 | 27 | 99 | 87 | 12 |
| 8 | 鳥栖 | 100 | 93 | 26 | 15 | 59 | 98 | 154 | -56 |
| 9 | 札幌 | 37 | 89 | 28 | 5 | 4 | 61 | 22 | 39 |
| 10 | 京都 | 44 | 89 | 28 | 5 | 11 | 79 | 48 | 31 |
| 11 | 水戸 | 101 | 89 | 26 | 11 | 64 | 90 | 178 | -88 |
| 12 | 浦和 | 36 | 75 | 24 | 3 | 9 | 70 | 39 | 31 |
| 13 | 横浜F | 64 | 64 | 19 | 7 | 38 | 77 | 111 | -34 |
| 14 | 甲府 | 101 | 61 | 17 | 10 | 74 | 85 | 207 | -122 |
| 15 | C大阪 | 20 | 38 | 11 | 5 | 4 | 44 | 29 | 15 |
| 16 | 福岡 | 20 | 28 | 7 | 7 | 6 | 27 | 20 | 7 |
