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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 大分 | 91 | 182 | 58 | 8 | 25 | 157 | 88 | 69 |
| 2 | 大宮 | 92 | 161 | 50 | 11 | 31 | 133 | 96 | 37 |
| 3 | 新潟 | 92 | 159 | 49 | 12 | 31 | 156 | 106 | 50 |
| 4 | 仙台 | 76 | 142 | 45 | 7 | 24 | 129 | 107 | 22 |
| 5 | 山形 | 92 | 129 | 39 | 12 | 41 | 103 | 108 | -5 |
| 6 | 湘南 | 92 | 113 | 34 | 11 | 47 | 120 | 140 | -20 |
| 7 | 川崎 | 60 | 91 | 28 | 7 | 25 | 95 | 79 | 16 |
| 8 | 京都 | 44 | 89 | 28 | 5 | 11 | 79 | 48 | 31 |
| 9 | 札幌 | 32 | 81 | 26 | 3 | 3 | 56 | 18 | 38 |
| 10 | 鳥栖 | 91 | 81 | 23 | 12 | 56 | 90 | 145 | -55 |
| 11 | 水戸 | 92 | 81 | 24 | 9 | 59 | 82 | 166 | -84 |
| 12 | 浦和 | 32 | 65 | 21 | 2 | 9 | 58 | 34 | 24 |
| 13 | 横浜F | 60 | 60 | 18 | 6 | 36 | 74 | 105 | -31 |
| 14 | 甲府 | 92 | 57 | 16 | 9 | 67 | 78 | 187 | -109 |
| 15 | C大阪 | 16 | 29 | 8 | 5 | 3 | 31 | 21 | 10 |
| 16 | 福岡 | 16 | 23 | 6 | 5 | 5 | 21 | 14 | 7 |
