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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 大分 | 98 | 195 | 62 | 9 | 27 | 175 | 96 | 79 |
| 2 | 大宮 | 98 | 174 | 54 | 12 | 32 | 143 | 102 | 41 |
| 3 | 新潟 | 98 | 162 | 50 | 12 | 36 | 163 | 125 | 38 |
| 4 | 仙台 | 83 | 145 | 46 | 7 | 30 | 137 | 121 | 16 |
| 5 | 山形 | 98 | 135 | 41 | 12 | 45 | 112 | 120 | -8 |
| 6 | 湘南 | 98 | 122 | 37 | 11 | 50 | 131 | 151 | -20 |
| 7 | 札幌 | 39 | 95 | 30 | 5 | 4 | 67 | 22 | 45 |
| 8 | 鳥栖 | 98 | 94 | 27 | 13 | 58 | 96 | 155 | -59 |
| 9 | 水戸 | 98 | 90 | 27 | 9 | 62 | 88 | 171 | -83 |
| 10 | 京都 | 44 | 89 | 28 | 5 | 11 | 79 | 48 | 31 |
| 11 | 川崎 | 59 | 88 | 27 | 7 | 25 | 93 | 78 | 15 |
| 12 | 浦和 | 39 | 84 | 27 | 3 | 9 | 80 | 40 | 40 |
| 13 | 横浜F | 59 | 60 | 18 | 6 | 35 | 74 | 104 | -30 |
| 14 | 甲府 | 99 | 60 | 17 | 9 | 73 | 85 | 207 | -122 |
| 15 | C大阪 | 15 | 26 | 7 | 5 | 3 | 30 | 21 | 9 |
| 16 | 福岡 | 15 | 23 | 6 | 5 | 4 | 21 | 13 | 8 |
