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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 大分 | 86 | 169 | 54 | 7 | 25 | 154 | 88 | 66 |
| 2 | 大宮 | 87 | 154 | 48 | 10 | 29 | 128 | 93 | 35 |
| 3 | 新潟 | 87 | 144 | 44 | 12 | 31 | 139 | 102 | 37 |
| 4 | 仙台 | 77 | 142 | 45 | 7 | 25 | 130 | 111 | 19 |
| 5 | 山形 | 87 | 125 | 38 | 11 | 38 | 100 | 104 | -4 |
| 6 | 湘南 | 87 | 109 | 33 | 10 | 44 | 118 | 132 | -14 |
| 7 | 京都 | 44 | 89 | 28 | 5 | 11 | 79 | 48 | 31 |
| 8 | 札幌 | 33 | 84 | 27 | 3 | 3 | 58 | 18 | 40 |
| 9 | 川崎 | 54 | 81 | 25 | 6 | 23 | 85 | 72 | 13 |
| 10 | 鳥栖 | 86 | 81 | 23 | 12 | 51 | 85 | 132 | -47 |
| 11 | 水戸 | 87 | 72 | 21 | 9 | 57 | 77 | 162 | -85 |
| 12 | 浦和 | 32 | 65 | 21 | 2 | 9 | 58 | 34 | 24 |
| 13 | 横浜F | 54 | 53 | 16 | 5 | 33 | 70 | 98 | -28 |
| 14 | 甲府 | 87 | 52 | 15 | 7 | 65 | 72 | 178 | -106 |
| 15 | C大阪 | 10 | 18 | 5 | 3 | 2 | 20 | 10 | 10 |
| 16 | 福岡 | 10 | 18 | 5 | 3 | 2 | 18 | 9 | 9 |
